大棚辣椒根腐病一般发生于辣椒定植后至采果盛期，初期症状是一株和一株几个枝发生萎蔫，最后导致全株甚至全棚辣椒死亡。死亡株的根茎部变成褐色腐烂。高温、高湿、连作地、粘土地、低洼地等条件下易与发病。其防治技术如下。
    1.实行轮作  在茬口安排上，辣椒与大蒜、大葱实行轮作。
    2.杜绝传染源  育苗前种子用2%氢氧化钠处理15分钟，并进行搓洗，杀灭种子上的细菌。
    3.起垄栽培  整地时整成90厘米的垄，一垄栽两行，浇水以小水浇为主，做到水到即干，防止田间积水。
    4.拔除病株  发现病株及时拔除，然后用生石灰封闭发病株穴，以防止向外传播。
    5.药剂灌根  定植缓苗后，于发病前用五氯硝基苯200倍液加福美双600倍液灌根，连灌3—4次。