包衣种子一般有剧毒，只能做种子用，绝对不能食用或做饲料，就连包衣种子出苗后所间的苗也不能用来喂牲畜，以免中毒。装包衣种子的包装袋用后应烧毁或深埋。严防误装粮食和食品。盛装包衣种子的用具须经彻底洗净后方可使用。包衣种子不宜进行浸种催芽。因种衣剂溶于水后可能会对种子的萌发产生抑制作用，包衣种子不宜在低洼易涝地和盐碱地使用。包衣种子在高湿的土壤条件下极易方发生酸败腐烂；在盐碱地，种衣剂遇碱会分解失效。在PH值大于8的田地不宜使用包衣种子。包衣种子忌与敌稗等除草剂同时使用，播种后30天才能使用敌稗。如先用敌稗则需3天后在播种，否则容易发生药害或降低种衣剂的使用效果。